Для заглушки Vesta берёт первый домен, до которого дотянется в файле /etc/httpd/conf.d/vesta.conf. Заходим на сервер по ssh и открываем его:
Перед нами список подгружаемых конфигурационных файлов. Нужно найти путь до конфига необходимого сайта-заглушки и перенести его в начало, но после стандартных conf-файлов.
sudo service httpd restart